STIKES  Muhammadiyah Kudus berubah bentuk menjadi Universitas Muhammadiyah Kudus (UMKU) sesuai SK KEMENRISTEKDIKTI Republik Indonesia Nomor : 879/KPT/I/2018 tertanggal 12 Oktober 2018. Universitas Muhammadiyah Kudus memiliki 11 (sebelas) Fakultas yaitu Fakultas Kebidanan, Fakultas Keperawatan, Fakultas Farmasi, Fakultas Kesehatan, Fakultas Gizi, Fakultas Ekonomi & Bisnis, Fakultas Hukum, Fakultas Komputer, Fakultas Keguruan dan Pendidikan, Fakultas Teknik dan Fakultas MIPA

Fakultas Farmasi didirikan sesuai dengan SK Badan Pembina Harian Universitas Muhammadiyah Kudus No 09/BPH-UMKU/X/2018 tertanggal 17 Oktober 2018. Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Kudus mempunyai 2 (dua) Program Studi yaitu Program Studi S-1 Farmasi dan Profesi Apoteker.